Le Lac Natron se trouve dans le nord de la Tanzanie, à un peu plus de 100 km au nord-ouest de la ville d’Arusha. Il se trouve au pied du seul volcan d’Afrique, Oldonyo Lengai ou la montagne de Dieu. Le lac mesure 56 km de long du nord au sud et 24 km de large. La région reçoit des précipitations saisonnières irrégulières, principalement entre décembre et mai.
Ce lac est proche d’autres parcs nationaux, tels que le lac Manyara, la zone de conservation de Ngorongoro au sud et le parc national du Serengeti du Nord à l’ouest. Il est parfaitement positionné pour être intégré à un safari dans les parcs du nord de la Tanzanie.